論文，書籍等出版物，会議・講演等
論文
- Lattice protein design using Bayesian learning
Tomoei Takahashi, George Chikenji and Kei Tokita
Physical Review E, 104, 014404, 2021.7 - 生物進化の渋滞モデルと種個体数分布
時田恵一郎, 佐藤純
第26回交通流と自己駆動粒子系シンポジウム論文集 (26) 頁:1-4 2020年12月 - 腸内細菌叢の数理モデルとその相互作用行列の解析
田口優真, 時田恵一郎
京都大学数理解析研究所考究録 (2166) 頁:72-76 2020年7月 - アリ・アブラムシ系の個体群ダイナミクス -共生と捕食のスイッチング
中井貴生, 時田恵一郎
京都大学数理解析研究所講究録 (2166) 頁:54-58 2020年7月 - ソーシャルボットの検出:言語非依存性の特徴量とボット集団の定量化
杉森真樹, 笹原和俊, 時田 恵一郎
2018年度人工知能学会全国大会（第32回） 2018年6月 - Relative species abundance of replicator dynamics with sparse interactions
Tomoyuki Obuchi, Yoshiyuki Kabashima and Kei Tokita
Journal of Statistical Mechanics 頁:113502 2016年11月 - Multiple peaks of species abundance distributions induced by sparse interactions
Tomoyuki Obuchi, Yoshiyuki Kabashima and Kei Tokita
Physical Review E 94巻 頁:02231 2016年8月 - Dynamic stability and chaotic multispecies-coexistence in a food web mode
Kei Tokita
Advances in Science, Technology and Environmentology (ASTE, Waseda University) 頁:000 2015年2月 - Properties of ecosystems those are vulnerable during eco-fusion
Katsuhiko Yoshida, Kei Tokita
Scientific Reports 5巻 頁:7939 2015年1月 - Analytical theory of species abundance distributions of a random community model
Kei Tokita
Population Ecology 57巻 ( 1) 2015年1月 - GPGPU simulations of 2D lattice neutral models in ecology
Takeshi Oura and Kei Tokita
Journal of Physics: Conference Series 454巻 頁:012038 (7pages) 2013年 - Species-area relationship for power-law species abundance distribution
Haruyuki Irie and Kei Tokita
International Journal of Biomathematics 5巻 頁:1260024 (9 pages) 2012年5月 - Rank abundance relations in evolutionary dynamics of random replicators
Yoshimi Yoshino, Tobias Galla and Kei Tokita
Physical Review E 78巻 頁:031924 (1 pages) 2008年9月 - Statistical mechanics and stability of a model eco-system
Yoshimi Yoshino, Tobias Galla and Kei Tokita
Journal of Statistical Mechanics 頁:P09003 (24 pages) 2007年9月 - Statistical mechanics of relative species abundance
Kei Tokita
Ecological Informatics 1巻 頁:315-324 2006年11月 - Species abundance patterns in complex evolutionary dynamics
Kei Tokita
Physical Review Letters 93巻 頁:178102 (4 pages) 2004年10月 - Emergence of a complex and stable network in a model ecosystem with extinction and mutation
Kei Tokita and Ayumu Yasutomi
Theoretical Population Biology 63巻 頁:131-146 2003年 - Large-Dimensional Replicator Equations with Antisymmetric Random Interactions
Tsuyoshi Chawanya and Kei Tokita
Journal of Physical Society of Japan 71巻 ( 2) 頁:429-431. 2002年 - Dynamical Equation Approach to Protein Design
Kei Tokita, Macoto Kikuchi and Yukito Iba
Progress of Theoretical Physics Supplement 138巻 頁:378-383 2000年
著書
- Transformations of Social-Ecological Systems
Sato, T., Chabay I., Heigeson, J. eds.（担当：共著）
Springer 2019年1月 - 地域環境学
佐藤哲 編, 菊地直樹 編（担当： 共著）
東京大学出版会 2018年1月 （ ISBN:978-4-13-060320-1 ） - 岩波 生物学辞典 第5版
巌佐庸・倉谷滋・斎藤成也・塚谷裕一（編集）（担当： 共著）
岩波書店 2013年2月 - 数理科学事典
現代数理科学事典編集委員会（担当： 共著）
丸善 2009年12月 （ ISBN:978-4621081259 ） - 生物間ネットワークを紐とく
大串 隆之 (編集), 難波 利幸 (編集), 近藤 倫生 (編集)（担当： 共著）
京都大学出版会 2009年8月 - ネットワーク科学への招待
青山秀明・相馬亘・藤原義久 共編著（担当： 共著）
サイエンス社 2008年7月 - 進化経済学ハンドブック
進化経済学会（編集）（担当： 共著）
共立出版 2006年9月 - プラントミメティックス
甲斐昌一 , 森川弘道, 鈴木泰博（編集）（担当： 共著）
エヌ・ティー・エス 2006年8月 - 複雑系の構造と予測
早稲田大学複雑系高等学術研究所 (編集)（担当： 共著）
共立出版 2006年6月 - ゲーム理論のフロンティア
松田裕之・池上高志（共編著）（担当： 共著）
サイエンス社 2005年12月 - 生態学辞典
巌佐 庸 (編集), 菊沢 喜八郎 (編集), 松本 忠夫 (編集), 日本生態学会 (編集)（担当： 共著）
共立出版 2003年6月 - 複雑さの数理
相澤洋二（監訳）, 龍野正実, 時田恵一郎, 橋本敬, 秦浩起（訳）（担当： 共著）
産業図書 2001年7月 - 脳科学大辞典
甘利 俊一 (編集), 外山 敬介 (編集)（担当： 共著）
朝倉書店 2000年4月 - Unifying Themes in Complex Systems
Kei Tokita, et al.（担当： 共著）
Perseus Books 2000年
会議・講演等
国際会議
- Theory of Species Abundance Distribution of Evolutionary Dynamics
Kei Tokita
7th China-India-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CIJK 2019) - Domain theoretical approach to boolean networks
Shojiro Abe, Kei Tokita
7th China-India-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CIJK 2019) - Evolution of In-group Favoritism and Game Theoretical Analysis
Taishu Murakami, Kei Tokita
7th China-India-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CIJK 2019) - Protein design using Bayesian learning
Tomoei Takahashi, George Chikenji, and Kei Tokita
7th China-India-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CIJK 2019) - Dynamic theory of species abundance distributions
Kei Tokita
The 8th East Asian Federation of Ecological Societies International Congress - Statistical mechanics of population dynamics
Kei Tokita
Seminar of Department of Physics, Inha University - Overview of theoretical modeling on species abundance distribution
Kei Tokita
Seminar of Department of Physics, Inha University - Species-abundance relationships in inferring pollution impacts on benthic macroinvertebrate communities in streams
T.S. Chon, X.D. Qu, M.Y. Song, K. Tokita, Y.S. Park
The International Society for Ecological Modelling Global Conference 2017 - Diversity, stability and the relative species abundance of replicator dynamics with complex interspecies interactions
K. Tokita
The international Society for Ecological Modelling Global Conference 2017 - Diversity, stability and the relative species abundance of replicator dynamics with complex interspecies interactions
Kei Tokita
6th China India Japan Korea Mathematical Biology Colloquim (CIJKMB) - Theory of Species Abundance Distributions in Community Ecology
Kei Tokita
The 7th EAFES International Congress, Daegu, Korea - The Science of Biodiversity: Theoretical Perspectives
Kei Tokita
The International Research Unit of Advanced Future Studies, Kyoto University - Biological and social communications
Kei Tokita
Joint Conferenece of 2015 Annual Meeting of Japanese Society for Mathematical Biology and 2015 5th China-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CJKICMB2012) - Statistical mechanics of competitive exclusion of ecological communities
Takeshi Oura and Kei Tokita
Joint Conferenece of 2015 Annual Meeting of Japanese Society for Mathematical Biology and 2015 5th China-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CJKICMB2012) - Degree of interactions essentially changes relative species abundance
Tomoyuki Obuchi, Yoshiyuki Kabashima and Kei Tokita
Joint Conferenece of 2015 Annual Meeting of Japanese Society for Mathematical Biology and 2015 5th China-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology (CJKICMB2012) - Molecular mimicry model of autoimmune disease
Kei Tokita, Megumi Masuda, Akira Sasaki
Annual Meeting of Society for Mathematical Biology - Statistical mechanics of evolutionary dynamics: an answer to the diversity-stability debate in community ecology
Kei Tokita
New Challenges in Complex System Science - Spatially Explicit Neutral Model
Kei Tokita and Takeshi Oura
Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology (JSMB/SMB2014)
国内会議・講演会
- 大規模群集モデルに対応したパラメータ推定手法
田口優真,時田恵一郎
第68回日本生態学会大会 2021年3月18日 - 水の効果を外場とした格子タンパク質の経験ベイズ法によるデザイン
高橋智栄,千見寺浄慈,時田恵一郎
日本物理学会第76回年次大会 2021年3月14日 - 大自由度非線形進化力学系への統計力学的手法の応用
田口優真,時田恵一郎
第6回数理生物学交流発表会 2021年3月7日 - 宍道湖・中海生態系の数理モデリング
時田恵一郎,川元琢,坂野鋭
汽水域合同研究発表会2021 2021年1月9日 - 生物進化の渋滞モデルと種個体数分布
時田恵一郎,佐藤純
第26回交通流と自己駆動粒子系シンポジウム 2020年12月10日 - 大規模群集モデルのパラメータ推定
田口優真,時田恵一郎
2020年度日本数理生物学会年会 2020年9月22日 - 経験ベイズ推定を用いた水の効果の最適化によるタンパク質デザイン
高橋智栄,千見寺浄慈,時田恵一郎
日本物理学会2020年秋季大会 2020年9月9日 - 相利的な非線形進化力学系での捕食やコストがもたらす多形の創出
中井貴生,乾陽子,時田恵一郎
日本物理学会 第75回年次大会 2020年3月18日 - 経験ベイズ推定による格子タンパク質模型のデザイン
高橋智栄,千見寺浄慈,時田恵一郎
日本物理学会第75回年次大会 2020年3月17日 - 多自由度非線形進化力学系の相互作用行列の推定
田口優真, 時田恵一郎
日本物理学会第75回年次大会 2020年3月18日 - 食物網のサンプリング理論と種個体数分布
時田恵一郎
日本物理学会第75回年次大会 2020年3月18日 - 内集団ひいきの創発
村上大周, 時田恵一郎
ゲーム理論ワークショップ2020 - アリ-アブラムシ系の個体群ダイナミクス
中井貴生,乾陽子,時田恵一郎
第67回日本生態学会大会 2020年3月7日 - 腸内細菌叢の数理モデルとその相互作用行列の解析
田口優真, 時田恵一郎
第67回日本生態学会大会 2020年3月6日 - 食物網のサンプリング理論と種個体数分布
時田恵一郎
第67回日本生態学会大会 2020年3月6日 - アリ・アブラムシ系の個体群ダイナミクス〜共生と捕食のスイッチング〜
中井貴生,乾陽子,時田恵一郎
生物数学の理論とその応用〜生命現象の定量的理解に向けて〜 2020年1月28日 - 腸内細菌叢の数理モデルとその相互作用行列の解析
田口優真, 時田恵一郎
第16回 生物数学の理論とその応用〜生命現象の定量的理解に向けて〜 2020年1月29日 - 2パッチモデルとしての宍道湖−中海生物分布シミュレーション
川元琢, 時田恵一郎, 坂野鋭
第27回汽水域研究発表会・汽水域研究会第8回例会・汽水域合同研究発表会2020 2020年1月11日 - アリ-アブラムシ系の個体群ダイナミクス
中井貴生,乾陽子,時田恵一郎
2019年度日本生態学会中部地区大会 2019年11月16日 - アリ-アブラムシ系の個体群ダイナミクス
中井貴生, 時田恵一郎
第12回水戸MI(数学・情報数理)セミナー 2019年10月30日 - 共生と多型に関する数理モデル
中井貴生,時田恵一郎
2019年度日本数理生物学会年会 2019年9月14日-16日 - ブーリアンネットワークのアトラクター数に関する領域理論的研究
安部翔士郎, 時田恵一郎
日本物理学会秋季大会 2019年9月12日 - 相互作用グラフの特徴を考慮したベイズ学習によるタンパク質デザイン
高橋智栄, 千見寺浄慈, 時田恵一郎
日本物理学会秋季大会 2019年9月12日 - 内集団ひいきの進化とゲーム理論的解析
村上大周, 時田恵一郎
日本物理学会秋季大会 2019年9月13日 - 共生と多型に関する数理モデル
中井貴生,時田恵一郎
第2回数理生物学若手の会 夏の学校 2019年8月30日 - 腸内細菌叢の生態系
田口優真,時田恵一郎
第2回数理生物若手の会 夏の学校 2019年8月30日 - 内集団ひいきのゲーム理論的解析
村上大周,時田恵一郎
第64回物性若手夏の学校 2019年8月4日-9日 - ベイズ学習による格子タンパク質デザイン
高橋智栄, 千見寺浄慈, 時田恵一郎
第64回物性若手夏の学校 2019年8月4日-9日 - 階層社会の自己組織化
村上大周, 時田恵一郎
日本物理学会第74回年次大会 2019年3月14日 - ベイズ学習による格子タンパク質模型のデザイン
高橋智栄, 千見寺浄慈, 時田恵一郎
日本物理学会第74回年次大会 2019年3月17日 - 機械学習と物理学のつながり
時田恵一郎
核融合科学研究所セミナー - 生態ネットワークの種個体数分布
時田恵一郎
京都大学生態学研究センターセミナー 2019年1月18日 - 多様性の科学に対する統計物理学的アプローチ
時田恵一郎
経済・社会への分野横断的研究会 - Partial annealing as evolution in a model ecosystem
Tim Ritmeester, Kei Tokita
日本物理学会大73回年次大会 2018年3月22日 - 二部グラフ型ホストーパラサイトモデルからホスト間相互作用のあるえこえぴモデルへ
時田恵一郎
日本生態学会大65回全国大会 2018年3月9日 - 機械学習を用いたソーシャルボットの検出と分析：英語と日本語の比較
杉森真樹, 笹原和俊, 時田恵一郎
第2回計算社会学ワークショップ 2017年12月13日 - 蝶とウイルスの擬態
時田恵一郎
DNA鑑定などに関する勉強会 - 大陸島嶼生態系の二次元格子中立モデル
長瀬久在, 時田恵一郎
日本物理学会第72回年次大会 2017年3月19日 - TAP平均場近似アルゴリズムを用いた協調フィルタリング型ボルツマンマシン学習
日當泰輔, 時田恵一郎
日本物理学会第72回年次大会 2017年3月17日 - 三題噺：米大統領選挙, SYNC, 言語進化
時田恵一郎
国際高等研究所研究会「総合コミュニケーション学」 - TAP平均場近似による制限ボルツマンマシン学習と協調フィルタリングへの応用
日當泰輔, 時田恵一郎
日本物理学会2016年秋季大会 2016年9月14日 - 食物網の種個体数分布II
時田恵一郎
日本物理学会2016年秋季大会 2016年9月16日 - Species abundance patterns of a food web model
Kei Tokita
Japanese Society for Mathematical Biology annual meeting(JSMB2016) 2016.9.7 - 正直シグナル
時田恵一郎
国際高等研究所研究会「総合コミュニケーション学」 - 生物・社会ネットワークの種個体数分布
時田恵一郎
物理学的普遍性から生物学的普遍性へ 2016年8月4日 - 統計力学を使って生物や社会における多様性の起源を探る
時田恵一郎
核融合科学研究会・特別講演会 - 様々なスケールで見られる生物の信号とコミュニケーション：蝶とウィルスの擬態
時田恵一郎
第2回 非線形現象の捉え方 2016年5月15日 - 食物網モデルの種個体数分布
時田恵一郎
日本生態学会第63回全国大会 2016年3月22日 - 相関構造のある相互作用行列をもつランダムレプリケーター方程式
大浦健志, 時田恵一郎
日本物理学会第71回年次大会 2016年3月19日 - TAP平均場近似による制限ボルツマンマシン学習と強調フィルタリングへの応用
日當泰輔,時田恵一郎
日本物理学会第71回年次大会 2016年3月19日 - 食物網モデルの種個体数分布
時田恵一郎
日本物理学会第71回年次大会 2016年3月19日 - 生物・社会ネットワークの非対称な世界
時田恵一郎
国際高等研究所研究会「ネットワークの科学」 - 生物多様性の科学
時田恵一郎
武蔵野大学 数理工学センター（MCME）セミナー 2016年2月12日 - ブロック構造をもつランダム行列の固有値分布
大浦健志, 時田恵一郎
日本物理学会第70回年次大会 2015年3月24日 - ランダム相互作用をもつBouchaud-Mezardモデル
大浦健志, 時田恵一郎
日本物理学会第69回年次大会 2014年3月30日
他過去多数
社会貢献活動
- 名古屋大学教育学部付属高校SSHコア「数学的思考力を基盤に多領域に応答する人材の育成」第1ステージ講義「ベイズの定理」
名古屋大学教育学部附属中学・高等学校 2019年8月 - 名古屋大学教育学部付属高校SSHコア「数学的思考力を基盤に多領域に応答する人材の育成」第1ステージ講義「Introduction to Mathematical Biology」
名古屋大学教育学部附属中学・高等学校 2018年4月 - 韓国大邱市高校生向け出張講義
2016年12月 - 県立千葉中学校・高等学校出張講義
2016年11月